市販されているチオ硫酸ナトリウムは5水和物(Na₂S₂O₃・5H₂O)であり、俗にハイポ(hypo)と呼ばれている。尚、この名称は、その誤称である次亜硫酸ナトリウム(Sodium hyposulfite)に由来する。次亜硫酸ナトリウムとは亜ジチオン酸ナトリウム(Sodium dithionite : Na₂S₂O₄)の別名であり、チオ硫酸ナトリウムとは全く別の物質である。
チオ硫酸ナトリウムは水に良く溶け(20℃に於ける溶解度は70g/100g水)で、水溶液中では安定であるが、酸性水溶液では分解され、硫黄が遊離する。尚、チオ硫酸ナトリウムの飽和水溶液を冷却しても、過飽和により結晶が析出しない場合がある(過飽和水溶液に種結晶を入れると結晶が急速に成長してくる)。
チオ硫酸ナトリウムは還元力を持つので、水道水など塩素を含む水溶液にチオ硫酸ナトリウム水溶液を加えると、塩素を除去することができる。従って、金魚や熱帯魚を飼育する場合、水道水から塩素を除去する目的で少量のチオ硫酸ナトリウムを添加する。